1. Доходы с контекстной рекламы Яндекс.Директа держатся на уровне с Google Adsense, а за последние две недели даже обогнали. Это очень радует!
2. Хорошая служба поддержки. Быстро отвечают на возникшие вопросы, не ждешь ответов по несколько дней как в Google Adsense.
3. Контекстная реклама для поиска. Если у Вас на сайте организован поиск по содержимому сайта, то можно получить дополнительный доход.
4. Удобная форма оплаты в краткие сроки. Свои заработанные деньги Вы можете получить уже во втором месяце на свой Яндекс.Кошелек, либо по безналу (если Вы юр.лицо).
К недостаткам Яндекс.Директа отнесем:

1. Не очень удобный интерфейс. Я разбирался с ним несколько дней.
2. Объявления показываются не сразу. Должно пройти некоторое время, чтобы робот Яндекс.Директ проиндексировал страницы. Вывод - теряются показы.
3. Нет возможности размещения нескольких блоков на странице, что сокращает доходы с сайта.
4. Маленький выбор форматов баннеров, доступны только вертикальные.
5. Не возможности отслеживания, с каких страниц идут клики.
6. Привязка кода объявлений к конкретному сайту. Это значит если Ваш сайт будут просматривать во фреймах или в кэше поисковиков или других сайтов, то объявления транслироваться не будут.